种群遗传学(populationgenetics.)亦称“群体遗传学”。遗传学分支学科。研究种群遗传结构及其变化规律。 始于英国数学家G.H.哈迪和德国医学家温柏特1908年提出的平衡定律。应用数学和统计学方法。具体研究种群中的基因频率和基因型频率以及影响这些频率的选择效应和突变作用，还研究遗传渐变和迁移等与遗传结构的关系，由此探讨进化的机制。进化就是基因频率变化的过程。种群中个体互相交配繁殖，共享一个基因库。在很大的种群内，个体间可随机交配。如果没有突变和自然选择的压力，种群的基因频率保持稳定不变，但在自然选择和突变都存在时，种群的基因频率必然发生变动。自然选择可以海汰不利基因，也可造成杂种优势平衡。在自然条件和生存环境改变的长期作用下，种群基因频率会朝一个方向变化，就是定向选择，如，大量使用抗生素及农药，便会出现抗药菌株和耐药害虫，而由果蝇基因变型互配产生的杂合基因型占优势，则是杂交优势平衡选择的实例。当种群很小时，基因频率可能发生异常变化，迁移到新地区的少数个体可能会形成一个与原来迥然不同的种群。遗传差异积累到一定程度，便可能形成亚种，在存在生殖隔离时便形成新种，但这常需要许多世代。只要查明种群不同世代遗传结构的演变方式，就可以探讨动物的进化过程，并据以培育各种新的品系和品种。