世系和比较法(ancestryandcomparativemethod)研究动物适应行为的方法。若动物的祖先具有某种行为，而且现存的一代仍然出现这种行为，那么该行为一定是适应环境的，否则它一定会在世代交替中失传。动物的世系依据系统发育确定。如狗与猫的亲缘关系比与大鼠要接近些，与狼的亲缘关系比与猫又要接近些，因为狗和狼有着比猫更近的共同祖先。确定动物的系统发育关系要根据对古生物学、胚胎学、形态学、遗传学、动物地理学以及动物行为、血清蛋白、DNA等各方面的考察。其基本法则：有更多共同特征的动物比只有较少共同特征的动物具有更接近的亲缘关系。就好比兄弟姐妹比堂（表）兄弟姐妹有更多的共同特征，因为兄弟姐妹有共同的祖父母和外祖父母，而堂(表)兄弟姐妹只有共同的祖父母或外祖父母。通过相关物种追溯特定的行为模式。一种行为，如啃咬，在啮齿类动物中见于许多祖先，因此被认为是一种适应性行为，而爬树在啮齿类动物中只见于少数几个物种如松鼠，爬树的适应范围比啃咬小。许多树松鼠在警告或威胁其他松鼠时会发出犬吠似的尖叫声，使其捕猎者很容易发现它，但树松鼠能围着树干迅跑跳避，所以其叫声仍然具有一定的适应性。与此相比，许多地松鼠会发出高频率口技似的颤音，这种声音很难定位，也可认为是一种适应行为。因为地松鼠远离洞穴时很易被猎食动物抓获，发出难以定位的叫声有利于躲避敌害。有一种松鼠生活在岩石间，许多岩洞和裂缝可用来躲避敌害，与居住在树洞中的树松鼠更类似。据此可以推测，岩松鼠发出的警戒叫声像犬吠而易于定位，但还有待检定。借助比较法，还可作出其他类似的推测，如地松鼠被捕猎动物发觉以后，其警戒叫声的口技品质与逃脱的难度之间存在正相关关系。